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产品介绍

HiCuT(Hi-C Coupled chromatin cleavage and Tagmentation)是一种将Hi-C 3.0策略与CUT&Tag联合用于获得目标蛋白介导的DNA空间互作信息的创新技术,能够绘制以目标蛋白为中心的精细染色质构象。HiCuT对于分析基因表达的转录调控机制有重要作用。例如以H3K27ac为目标蛋白,HiCuT可以一次性锁定增强子元件及其相关互作,结合RNA-seq和ATAC-seq,获取增强子的靶基因及相关核心转录因子,更深层次地解析转录调控网络。


增强子、转录因子和DNA loop在基因表达调控的示意图(来源:www.amboss.com)



应用方向

1.在loop层级分辨率解析特定蛋白介导的染色质互作
2.研究转录因子、CTCF、Pol II等蛋白在调控染色质结构及转录表达中的作用

3.精确关联顺式调控元件与其靶基因,解析非编码SNP影响基因表达的机制




HiCuT技术路线


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