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精彩回顾 | 阮一骏教授讲座:三维基因组学&精准医学

发布时间:2023-2-2 9:40:34阅读次数: 分享到:

真核细胞中的染色质DNA高度折叠形成复杂的三维结构,其空间组织方式对精准调控基因的表达和细胞发挥正常功能都起着重要的作用。在人体细胞中,长达2米的基因组被几千倍地压缩包裹在微米数量级的细胞核中,要维持人体细胞的基本功能,基因组在细胞核内必定拥有精细的三维构造,从而通过协同作用完成各种分子生物化学的反应过程。2023年1月17日,应5848vip威尼斯电子游戏邀请,浙江大学生命科学院首席研究员,阮一骏教授来访5848vip威尼斯电子游戏武汉总部,以“三维基因组学&精准医学”为题做了精彩报告。


生物学中,基因组结构和功能存在深切联系。多年来,阮教授课题组专注于三维基因组学的研究,包括开发三维基因组前沿技术、揭示三维基因组的空间结构和功能,以及推动三维基因组技术在医学方向的转化应用。在此次报告中,阮教授首先介绍Hi-C和ChIA-PET的正式发布开启了高通量三维基因组学研究的时代,其后讲解了三维基因组结构对基因转录调控有着重要作用,并提出通过全面的基因组信息和基因组结构分析可以充分了解发育或发病过程中的分子机制。


其中,关于医学问题,阮教授在提到如何理解致癌性融合蛋白PML-RARa在白血病发生中的作用时,强调了三维基因组结构对于解析疾病发生过程的分子调控机制有着重要意义。对于医学遗传学问题,关键是确定基因型如何决定表型。针对于此,阮教授提出在基因型和表现型之间存在一个结构型,即基因型通过对结构型的影响从而达到对基因转录的调控。具体是在遗传性疾病中,关联变异和启动子之间的空间互作关系进而识别疾病相关的基因。因而当病患的编码/非编码区域发生遗传变异时,染色质环型拓扑结构变异,随后进一步导致基因表达调控的变异。阮教授认为,在复杂性状/疾病研究中引入染色质拓扑结构的视角,有助于提升对遗传信息流通的认识,促进对基因转录调控的深入探索,并且在临床上可以辅助明确靶标基因,助力精准诊断治疗。


科学技术的创新进步是科研成果突破的强劲动力。在揭秘疾病发生过程的调控机制时,多种高通量测序方案可以提供基因组、转录组、表观组和三维基因组等信息。这些方法通常需要足量样本才能保证数据质量。考虑到临床采集细胞数往往相对较少,而三维基因组技术需要大量细胞。因此低起始量的三维基因组技术将极大提升其在精准医学应用的影响。本次讲座中,阮教授分享了其团队最新发表于Nature Communications的新技术ChIATAC,通过从实验流程、数据质量和应用结果三个方面介绍了其在临床应用的优势,展示了该技术的多项优异特点,例如ChIATAC的实验过程简单有效,所需细胞量最低可达到1000个,并且可以同时检测开放的染色质位点和开放位点之间的染色质互作,以及能够显著富集得到介导转录的染色质环信息等等。


最后,阮教授对新一代3D基因组定位技术进行展望,分享了可以揭示染色质在基因转录过程中的动态空间折叠的单分子染色质相互作用技术ChIA-Drop,以及其单细胞版本single cell ChIA-Drop,并且提出单细胞和单分子多维度交互组学思路,建议同时获得单细胞水平的开放染色质、三维基因组和转录组等信息,提升单细胞数据的覆盖率,助力在未来的生命活动、疾病发生发展的分子机制研究中更好地探索突破。


阮教授在本次报告中介绍了三维基因组学对于研究基因型如何决定表现型具有重大意义,认为三维基因组技术在医学遗传学、精准医学上大有前景。并在报告后的开放讨论环节对现场和线上观众的问题作了详细答疑。


感谢阮教授的此次精彩报告,也感谢阮教授对5848vip威尼斯电子游戏在技术实力和科研成果上的肯定。5848vip威尼斯电子游戏秉承“以生物信息学助推生命科学的研究,以基因组医学促进人类健康的发展”的使命,将不断通过多维组学技术助力科学问题探索,并且通过打造整体解决方案来推进解析疾病的发生与发展机制。5848vip威尼斯电子游戏期待能够与阮教授持续进行深层次、多角度、全方位的技术交流与合作,共同增进三维基因组研究的发展和精准医学的进步。

讲座重要问题及答疑

链接:

https://pan.baidu.com/s/1EMRwhux73POwnhBWh_CxiA 

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