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Microorganisms丨NaHCO3胁迫对刺槐生理、生物化学和根际细菌群落的影响

IF：4.5

单位：东北林业大学

5848vip威尼斯电子游戏提供技术：二代16s

主要内容：

土壤盐渍化已经成为一个不容忽视的生态环境问题。四倍体刺槐是一种耐旱耐盐碱的豆科树种。根际细菌是植物根系中的主要功能微生物，在调节植物生长和增强抗逆性方面起着至关重要的作用。然而，关于盐碱胁迫对根际细菌群落结构影响的研究还很缺乏。在本研究中，我们用0、50、100和150 mM碳酸氢钠胁迫二倍体(2×)和四倍体(4×)16天。我们使用16S rDNA测序来研究根际细菌群落的变化。此外，研究还评价了土壤酶活性和植物生理特性，以探讨根际细菌对碳酸氢钠胁迫的响应。结果表明，在NaHCO3胁迫下，4×植株比2×植株表现出更好的耐碱性。同时，观察到低浓度NaHCO3胁迫显著增加了两种植物根际细菌的丰度，同时降低了它们的多样性。胁迫对根际细菌群落的影响随着胁迫浓度的增加而减弱。NaHCO3胁迫引起根际细菌群落组成的显著变化。此外，碱性盐胁迫影响根际细菌群落的多样性，这与土壤酶活性有关。这些数据将有助于我们更好地了解优势根际细菌群落与刺槐之间的关系。同时也为通过增强土壤细菌群落来进一步提高刺槐的耐碱性提供参考。

Genome Biology丨银耳单倍型T2T基因组助力解析新染色体形成和产孢稀少的机制

IF：12.3

单位：福建农林大学

测序策略：HiFi+ONT超长+Hi-C

主要内容：

该研究对银耳Tr01进行了完整、高质量的双核基因组测序和组装，它们在染色体数量、染色体长度、染色体构成和排序方面均存在差异，形成非对称关系。每个核基因组都为双速基因组，包含3条附属染色体和2个附属区室，没有BUSCO基因，容易丢失，并能影响细胞核之间的水平染色质转移。绝大部分担孢子的基因组构架和序列偏向于单体型A基因组，超1/3的担孢子为非整倍体，携带1~2条额外染色体，包括Chr12B和两条新染色体ChrN1和ChrN2。基于高质量的基因组，研究者提出一个假设：在减数分裂过程中，7条染色体部分配对形成一个大的复合体，随后在物理接触位点进行染色体间重组，导致新染色体的形成。Chr12B、ChrN1和ChrN2等无着丝粒染色体在减数分裂和有丝分裂期间的不规则迁移导致一些子细胞的非整倍性和大多数子细胞的不能正常生长。该研究为无孢（少孢）食用真菌育种提供了新思路。

J Biol Chem丨FACT 复合物通过协调全基因组染色质开放性和CTCF结合来调节转录

IF：4.8

单位：内蒙古大学

5848vip威尼斯电子游戏提供技术：ATAC-seq

主要内容：

众所周知，组蛋白伴侣因子在转录过程中促进染色质恢复。然而，FACT如何调节全基因组染色质可及性和转录因子结合的机制尚未完全阐明。通过功能丧失的研究，研究发现:成分Ssrp1对于DNA复制和DNA损伤修复是必需的，并且对于小鼠胚胎成纤维细胞中细胞相变和细胞增殖的进展也是必需的。在分子水平上，Ssrp1的缺失导致染色质可及性增加、CTCF结合增强以及基因表达动态范围的显著变化。因此，研究明确揭示了FACT复合体通过协调全基因组染色质可及性和CTCF结合来调节转录的独特机制。

BMC Plant Biology丨青藏高原野生鸢尾的花色多态性

IF：5.3

单位：中国科学院昆明植物研究所

5848vip威尼斯电子游戏提供技术：二代无参

主要内容：

花的颜色在吸引传粉者和促进环境适应方面起着至关重要的作用。研究花色多态性的原因并了解其对生态学和遗传学的潜在影响，可以加深对野生植物花色多态性的了解。研究检测了青藏高原紫花鸢尾和黄花鸢尾的潜在雌雄适宜性差异，筛选出了与花色变化相关的关键基因和正选择基因。结果表明，黄花表现出较高的花粉与胚珠的比例。黄色花是由于花色苷的损失而由紫色花衍生而来，F3H可能是通过表达调控和序列多态性影响花色变异的重要基因。此外，发现表明，在黄花中正向选择的基因可能参与核苷酸切除修复和植物-病原体的相互作用。F3H诱导了花色变异，随后对黄花的生态和正选择可能进一步增强植物对高寒环境的适应。