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BSA分析助力揭示黄瓜黄色果肉呈色新机制

题目:Cucumber abscisic acid 8-hydroxylase Csyf2 regulates yellow flesh by modulating carotenoid biosynthesis

期刊:Plant Physiology

发表时间:2023年7月

材料选择黄色果肉突变体yf-343与欧洲温室型黄瓜XUE1(白色果肉)杂交的F2群体

主要研究方法BSA-seq,转录组,代谢组

研究结果

为了克隆控制黄色果肉的基因,以白色果肉自交系XUE1yf-343为双亲构建分离群体进行遗传分析,结果表明:yf-343黄色果肉突变由单隐性基因控制,命名为yellow flesh-2(yf-2)。通过BSA-seq分析(SNP/InDel-index)方法,确定了Chr42.18 Mb的区域为候选区域。利用区间内8个多态性标记对F2个体进行基因分型,基因型和表型数据连锁分析将yf-2基因座精细定位至4.6 cm区域。为了进一步缩小yf-2的候选区域,使用该区域的两个侧翼标记,从1000F2中鉴定了七个重组体,连锁分析将yf-2基因座精细定位到63.56 kb的区间。精细定位区间内有8个候选基因,结合序列比对及基因表达分析,明确编码脱落酸-8-羟化酶(ABA8ox)的基因Csyf2为形成黄瓜黄色果肉的关键候选基因。


yf-2位点图位克隆



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