威尼斯5848vip电子游戏(wns认证网站)-BinG百科

您好,欢迎光临武汉5848vip威尼斯电子游戏信息有限公司
027-87224696 | marketing@frasergen.com | 中文|English 咨询客服
—— 经典案例 ——
产品介绍 结果展示 经典案例 常见问题
经典案例

全转录组解析油菜细胞质雄性不育系花药发育中的circRNA表达模式及ceRNA和miRNA-mRNA间的调控网络

物种:油菜

拉丁名Brassica campestris

样品选择:细胞质雄性不育系Bcpol97-05A和可育系Bcah97-01B,每株系3个生物学重复。

测序策略:lncRNA+smallRNA测序


研究结果

    1、通过全转录组测序,研究者从雄性不育系和可育系的花蕾中鉴定并注释了1443个circRNAs,两品系共有121个circRNAs 。其转录本广泛分布在所有10条染色体中。circRNAs分为三类,分别来源于外显子,内含子,外显子内含子区域,大部分长度为200-400 bp。

circRNA的鉴定


    2、雄性不育系和可育系进行差异比较分析,共鉴定出31个差异表达的circRNAs、47个差异表达的miRNAs和4779个差异表达的mRNAs。

表1 差异circRNA鉴定

表2 差异miRNA鉴定


    3、使用Target Finder软件鉴定了推测的DEmiRNA–DEmRNA相互作用。结果总共获得了170个DEmiRNA–DEmRNA相互作用。最终筛选了18个miRNAs和37个mRNAs组成的DEmiRNA–DEmRNA对。其中DEmRNA功能注释表明大部分miRNAs都与植物激素相关。如,bra-miR9556-5p可能通过靶向Bra008715参与水杨酸介导的信号通路和油菜素内酯生物合成过程。

miRNA介导的调控网络


    4、构建ceRNA网络,锁定一个circRNA、两个miRNAs和五个mRNAs(Bra006799、Bra013352、Bra022668、Bra029377和Bra038700) 组成的网络, 推测circRNA A02:23507399|23531438是在转录后水平调控花药发育的重要circRNAs。

DEcircRNA–DEmiRNA–DEmRNA网络构建


农学科研
表观遗传
基因组
重测序
转录调控
微生物
生物信息学服务
医学临检
实体瘤基因检测
血液肿瘤基因检测
心血管精准用药基因检测
单基因遗传病基因检测
病原基因检测
医学科研
三代测序技术
单细胞测序技术
二代测序技术
三维基因组学技术
市场与支持
市场动态
菲沙课堂
产品速递
关于5848vip威尼斯电子游戏
菲沙简介
菲沙团队
菲沙成果
技术平台
合作伙伴
联系我们
加入我们
校园招聘
社会招聘
联系我们
  • 电话:027-87224696
  • 传真:027-87224785
  • Email:support@frasergen.com
  • 地址:中国湖北省武汉市东湖高新技术开发区高新大道666号光谷生物城D3-1栋三楼
微信公众号
Copyright © 2018武汉5848vip威尼斯电子游戏信息有限公司 鄂ICP备13010493号-1. All Rights Reserved Designed by Wanhu

XML 地图