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iScience｜高质量的壁虎基因组为其染色体进化和环境适应性研究提供新见解

影响因子：5.8

作者单位：南京师范大学

5848vip威尼斯电子游戏提供服务：DNA和RNA的提取、Illumina、PacBio SMRT 测序、Hi-C

主要内容：

多疣壁虎（Gekko japonicus）隶属于爬行纲有鳞目壁虎科壁虎属，其生活史距今已有一亿多年，具有独特而富有研究价值的性状（解毒、再生性、体温调节），被国家林业局列为陆生野生动物。该研究通过PacBio和Hi-C测序构建了高质量的多疣壁虎基因组，其基因组大小为2.54 Gb，Contig N50=2.04 Mb，并将基因组序列锚定到19条染色体上。结合多种方法进行注释，共预测得到20503个蛋白编码基因，其重复序列与转座子元件占比分别为69.4%和65.87%。通过多疣壁虎与近缘物种的共线性分析确定了其染色体的进化。多疣壁虎的大部分染色体都与Anolis carolinensis的一条染色体有较强共线性，说明其祖先发生了染色体分裂和融合事件；而多疣壁虎与Gallus gallus的比较则证实了蜥蜴类染色体进化的多样性和复杂性。比较基因组学分析确定了多疣壁虎与其它爬行亚纲的分化时间大概为191.9个百万年前。通过对多疣壁虎中特有基因、扩张基因和正选择基因进行功能富集分析发现，一些富集的途径与嗅觉和味觉等感官和神经系统有关。然后进一步对多疣壁虎的特殊表型（苦味感知、解毒、表皮形成、体温调节等）的形成与适应机制进行了深入解析，为多疣壁虎的适应性进化与保护研究提供了新见解。

Nature Communications｜YAP/TAZ-S100B轴对米色脂肪神经的转录抑制作用

影响因子：16.6

作者单位：北京大学未来技术学院/北大-清华生命科学联合中心

5848vip威尼斯电子游戏提供技术：RNA-seq

主要内容：

米色脂肪与棕色脂肪不同，是由白色脂肪组织（WAT）通过刺激“褐化”产生，并诱导产热，已有研究发现米色脂肪能调节血糖和脂肪的动态平衡。交感神经在米色脂肪的发育和功能中起到关键作用,脂肪细胞分泌的神经营养分子S100B可以影响交感神经。而PRDM16是米色脂肪生物合成必不可少的转录共调控因子，可以促进产热基因表达。本研究发现YAP/TAZ蛋白可与C/EBPβ竞争结合PRDM16的锌指-2结构域，阻碍PRDM16-C/EBPβ复合体的形成，抑制神经营养因子S100B的表达，进而调控白色脂肪在不同生理病理情况下的交感神经分布。通过靶向YAP/TAZ-S100B轴增强交感神经支配，可以促进米色脂肪的生物生成和能量消耗，从而改善饮食诱导或年龄相关的肥胖及其伴随的代谢功能障碍。此外，干预YAP/TAZ-S100B通路可以改善饮食诱导或年老相关的肥胖及代谢紊乱，为肥胖的预防和治疗提供了新的线索和策略。

Adv Sci(Weinh)｜STAG2调节同源重组修复和对ATM(共济失调毛细血管扩张突变)抑制的敏感性

影响因子：15.1

作者单位：中山大学肿瘤医院

5848vip威尼斯电子游戏提供服务：CUT&Tag

主要内容：

基质抗原2(STAG2)是粘附素复合体的核心亚单位，在多种癌症中经常发生突变。粘附素复合体通过产生和维护DNA环参与3D基因组的组织。然而，STAG2在DNA修复中的作用及其治疗意义尚不清楚。研究发现敲除STAG2会减少同源重组（HR）修复导致双链断裂（DSBs）和染色体畸变增加，并导致对共济失调毛细血管扩张症突变抑制剂（ATMi）、Poly ADP核糖聚合酶（PARPi）或两者结合的超敏反应。STAG2缺失导致的HR受损主要是由于KMT5A的表达恢复所致，KMT5A进而将H4K20（H4K20me0）甲基化为H4K20me1，从而减少BRCA1-BARD1被招募至染色质。而且，STAG2的表达与癌症患者的不良预后相关。总之，本研究确定了STAG2是HR的重要调控因子，并阐明了STAG2突变型肿瘤的潜在治疗策略。

Gut Microbes｜GlcNac通过调节NK细胞增强宿主对流感的抵抗力

影响因子：12.2

作者单位：华中农业大学

5848vip威尼斯电子游戏提供服务：宏基因组数据分析

主要内容：

微生物群对于维持正常生命活动至关重要，它可以整合环境信号来调节宿主的免疫反应，对癌症、代谢疾病和病原感染的发病过程有非常重要的影响。然而，微生物群如何保护远端器官免受感染的机制尚未完全阐明。肠道代谢物是肠道微生物发挥抗流感作用的关键介质。研究人员通过代谢组学分析筛选不同程度流感抗性小鼠之间的功能性肠道代谢物，研究了肠道微生物群如何影响宿主对流感的抗性。该研究鉴定出8种与流感耐药性呈正相关的代谢物，并在体内和体外描述了GlcNac和腺苷的抗流感活性。研究人员假设特定细菌在感染期间产生GlcNac，对TL（高流感病毒耐药性）和TH（低流感病毒耐药性）组粪便微生物群进行了宏基因组测序，并评估了群落结构和微生物丰度，并确定了与其产生相关的肠道微生物包括Clostridium sp., P. sartorii，和A. muciniphila，可以直接或间接地增强肠道GlcNac的表达，从而通过调节NK细胞的比例和活性增强宿主的流感抗性。

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